Ви є тут

Круглий Стіл: Інтеграція програмного пакету CSD-Discovery в освітній процес. Досвід Інституту харчової біотехнології та геноміки НАН України

 

   15 травня 2026 р. у режимі мережевої конференції відбулося засідання круглого столу, присвячене застосуванню програмного забезпечення CSD-Discovery Кембриджського кристалографічного датацентру (CCDC — The Cambridge Crystallographic Data Centre) в освітньому процесі. Було розглянуто досвід Інституту харчової біотехнології та геноміки НАН України щодо використання програм та інформаційних ресурсів CSD/CCDC, зокрема пакету CSD-Discovery у підготовці аспірантів Інституту та студентів Київського національного університету імені Тараса Шевченка. Розрлянуто можливості подальшої співпраці організацій в аспекті освітнього процесу.

Учасники:
  • Д-р Ендрю Піл (Dr. Andrew Peel) — фахівець Кембриджського кристалографічного датацентру з питань освіти та популяризації науки, Кембридж, Англія, Велика Британія.
  • Д-р Іларія Джімонді (Dr. Ilaria Gimondi) — фахівець Кембриджського кристалографічного датацентру з питань освіти та популяризації науки, Кембридж, Англія, Велика Британія.
  • Д-р Карпов Павло Андрійович (Dr. Pavel Karpov) — завідувач лабораторії біоінформатики та структурної біології відділу геноміки та молекулярної біотехнології ДУ «Інститут харчової біотехнології та геноміки НАН України», Київ, Україна.

CSD (Cambridge Structural Database) є найбільшим у світі архівом тривимірних кристалографічних структур малих органічних та металоорганічних молекул. Офіційним куратором CSD є Кембриджський центр структурних даних – CCDC (The Cambridge Crystallographic Data Centre), який також є розробником передового програмного забезпечення. Пакет CSD-Discovery представляє широкі можливості для депонування, аналізу та керування депонованими кристалографічними даними, а також включає різноманітні програми для структурно-біологічних та біоінформатичних досліджень: 

  • GOLD для ліганд-білкового докінгу, 
  • CrossMiner для фармакофорного пошуку, 
  • Hermes  для тривимірної візуалізації, редагування та аналізу макромолекул, 
  • ConQuest  для пошуку інформації в базі даних CSD, 
  • Mercury  для візуалізації та аналізу тривимірних кристалічних структур, 
тощо.
 
З 2023 року в рамках програми FAIRE (Frank H. Allen International Research and Education Programme) нашому Інституту надано повний доступ до ресурсів та програмного забезпечення CCDC (ліцензія надана д.б.н. П.А. Карпову), в академічних дослідженнях та освітньому процесі.