Ви є тут

Лабораторія біоінформатики та структурної біології

Лабораторія біоінформатики та структурної біології створена в 2004 році як складова частина Відділу геноміки і біотехнології Інституту клітинної біології та генетичної інженерії НАН України і мала назву - Лабораторія структурної біології та біоінформатики.

У 2009 р. Лабораторія увійшла до складу Відділу геномікі та молекулярної біотехнології ДУ "IXБГ НАН України" як Лабораторія біоінформатики та структурної біології.

Від початку пріоритетними напрямками досліджень лабораторії було застосування методів структурної біології та біоінформатики для дослідження структури і динаміки цитоскелету. Зараз, пріоритетними напрямами досліджень є:

  • Вирішення обчислювальних задач дослідження цитоскелету: біоінформаційний пошук, ідентифікація та доказ функціонування відповідних білків та їх комплексів.
  • За допомогою методів молекулярної динаміки та структурної біології виконуються моделювання і дослідження потенційної функції структурних складових цитоскелету, а також білків, що приймають участь у процесах, пов'язаних із його функціонуванням.
  • Молекулярний дизайнin silico, створення баз даних і пошук низькомолекулярних речовин з підвищенною спорідненістю до цільових білків цитоскелету, рослинних і бактеріальних FtsZ-білків, протеїнкіназ і фосфатаз.
  • Біоінформаційний пошук сайтів посттрансляційних модифікацій білків цитоскелету и з'ясування їх роли.
  • Дослідження кіному і фосфатому рослин у зв'язку ізз'ясування ролі відповідних протеїнкіназ і фосфатаз у регуляції цитоскелету і клітинному циклі.
  • Застосуванняі розвиток методів обчислень у Грід, а також інших методів високопродуктивних обчислень для вирішення фундаментальних і прикладних задач дослідження цитоскелету.

Такимчином, у лабораторії успішно застосовується весь комплекс сучасних методів біоінформатики, структурної біології, хемоінформатикі і хемогеномікі. Лабораторія гармонійно інтегрована в структуру Iнституту і активно взаємодіє з відділами та лабораторіями, що виконують інструментальні дослідження. Співробітники лабораторіїприймають активну участь в українських та міжнародних наукових проектах. Лабораторія курує роботу обчислювального Грід-кластеру інституту і є базовою для міжнародної віртуальної організації VO CSLabGrid. (http://ifbg.org.ua/uk/cslabgrid).

Лабораторія біоінформатики та структурної біології

Лабораторія була створена у 2004 році як складова частина Відділу геноміки і біотехнології Інституту клітинної біології та генетичної інженерії НАН України і мала назву - Лабораторія структурної біології та біоінформатики.
У 2009 р. Лабораторія увійшла до складу Відділу геномікі та молекулярної біотехнології ДУ "IXБГ НАН України" як Лабораторія біоінформатики та структурної біології.
 

НОВИНИ ЛАБОРАТОРЇЇ:
 

Співробітники

Співробітники лабораторії біоінформатики та структурної біології

Завідувач лабораторії канд. біол. наук Карпов Павло Андрійович.

Науковий співробітник канд. баол. наук Співак Світлана Ігорівна.

Молодший науковий співробітник Демчук Олег Миколайович.

Провідний інженер Раєвський Олексій Володимирович.

Інженер Пидюра Микола Олександрович.

Аспірант Самофалова Дарія Олексіївна.

Напрямки роботи та проекти

  • 2009-2010 НАН України та НТЦУ (STCU#5215) "Програма цільових досліджень та розвиваючих ініціатив” 2009-2010 рр. (STCU#5215) за темою: "Пошук ефективних інгібіторів протеїнфосфатаз за допомогою нанохімічних підходів і оцінка їх біологічної ефективності in silico" / "Search of effective protein phosphatases inhibitors using nanochemical approaches and evaluation of their biological activity in silico". (керівник проекту П.А.

Публікації

 
Karpov P.A., Nadezhdina E.S., Yemets A.I., Matusov V.G., Nyporko A.Yu., Shashina N.Yu. Blume Ya.B. Bioinformatic Search of Plant Microtubule- and Cell Cycle Related Serine-Threonine Protein Kinases. // BMC Genomics. 2010, 11(Suppl 1): S14. – doi:10.1186/1471-2164-11-S1-S14
http://www.biomedcentral.com/1471-2164/11/S1/S14